Одделенијата во Секторот се:
- Одделение за меѓународна соработка и проекти
- Одделение за правни работи и нормативна дејност
- Одделение за сметководствено- финансиски работи и аналитика на побарувања
- Одделение за управување со човечки ресурси, односи со јавност и логистика
- Одделение за комерцијални работи, јавни набавки и наплата на побарувања
